अलीगढ़ मुस्लिम यूनिवर्सिटी के कल्चर और पसमांदा मुसलमानों के साथ भेदभाव का मुद्दा गरमा रहा है। ऐसे में पसमांदा आंदोलन के प्रखर बुद्धिजीवी डॉ. फैयाज़ अहमद फ़ैज़ी ने बयान दिया कि यूनिवर्सिटी में अशराफ वर्ग के वर्चस्व के चलते कट्टरपंथ को बढ़ावा मिलता है, जिसके विचार पाकिस्तान बनवाने वाली मुस्लिम लीग से मिलते जुलते होते हैं।
देसज मुसलमानों के स्वभाव और संस्कृति के उलट अशराफ संस्कृति युवाओं को रूढ़िवाद की ओर धकेलती है। उन्होंने यूनिवर्सिटी के नए कुलपति के पद पर ख्वाजा मोइनुद्दीन चिश्ती उर्दू यूनिर्सिटी के कुलपति रहे प्रोफेसर मसऊद आलम फलाही को नियुक्त करने की मांग की है।
